วัด สเวยัมภูนาถเป็นหนึ่งในสถานที่ศักดิ์สิทธิ์ทางพุทธศาสนาที่มีชื่อเสียงในหุบเขากาฐมา ณฑุ ทางตะวันตกของเมืองกาฐมาณฑุ ชื่อสเวยัมภูนาถ หรือที่รู้จักกันในภาษาท้องถิ่นว่า ซิมภู มาจากคำว่า ซิงกู ซึ่งหมายถึง 'เกิดขึ้นเอง' ชาวต่างชาติเรียกวัดนี้ว่าวัดลิง สำหรับชาวเนวาร์ท้องถิ่นแล้ว ที่นี่เป็นสถานที่แสวงบุญทางพุทธศาสนาที่ศักดิ์สิทธิ์ที่สุด ส่วนสำหรับชาวทิเบตและผู้ที่นับถือพุทธศาสนาแบบทิเบต ที่นี่เป็นสถานที่ศักดิ์สิทธิ์สำคัญอันดับสองรองจากวัดโบธนาถ
กลุ่มอาคารประกอบด้วยเจดีย์ ศาลเจ้า และวัดต่างๆ ซึ่งบางส่วนสร้างขึ้นในสมัยราชวงศ์ลิจฉวี ส่วนอารามทิเบต พิพิธภัณฑ์ และห้องสมุดนั้นสร้างขึ้นในภายหลัง เจดีย์มีภาพวาดดวงตาและคิ้วของพระพุทธเจ้าอยู่ ระหว่างดวงตาและคิ้วมีเครื่องหมายคล้ายเครื่องหมายคำถาม เรียกว่า สุขาวดี (ทางสู่สวรรค์) สถานที่แห่งนี้มีทางเข้าสองทาง คือ บันไดที่ทอดยาวขึ้นไปสู่แท่นหลักของวัดโดยตรง ซึ่งอยู่บนยอดเขาทางทิศตะวันออก และถนนสำหรับรถยนต์ที่อ้อมเนินเขาจากทางทิศใต้ไปยังทางเข้าทิศตะวันตกเฉียงใต้ สิ่งแรกที่จะเห็นเมื่อขึ้นไปถึงยอดบันไดคือ วัชระ (คทาสายฟ้า)
รูปเคารพของสไวยัมภูนาถมาจากประเพณีวัชรยานของพุทธศาสนานิวาร์ อย่างไรก็ตาม สถานที่แห่งนี้ยังเป็นสถานที่สำคัญสำหรับชาวพุทธหลายนิกายและเป็นที่เคารพนับถือของชาวฮินดูด้วย ตามคัมภีร์โกปาลราชวัมสบาลี ระบุว่าสร้างขึ้นโดยพระเจ้าวีรเศรษฐินีของพระเจ้ามณเทวะ (ค.ศ. 464-505) ประมาณต้นศตวรรษที่ 5 ซึ่งดูเหมือนจะได้รับการยืนยันจากจารึกหินที่ชำรุดที่พบในสถานที่นั้น ซึ่งบ่งชี้ว่าพระเจ้าวีรเศรษฐินีทรงสั่งให้ดำเนินการก่อสร้างในปี ค.ศ. 640 ตามที่เพอร์ซิวัล บราวน์กล่าว สไวยัมภูนาถมีอายุ 2000 ปี ตามที่เจซี เร็กมีกล่าว สไวยัมภูนาถสร้างขึ้นในสมัยคิรัต ก่อนสมัยลิจฉวี
ตามคัมภีร์สไวัมภูปุราณะ เล่าว่า หุบเขาทั้งหมดเคยเป็นทะเลสาบที่มีงูอาศัยอยู่ พระพุทธเจ้าบิปัสวีทรงปลูกเมล็ดบัวลงไปและได้งอกเป็นดอกบัว เมื่อทรงทราบถึงพระศิวะ (เปลวไฟคริสตัล) พระมัญจุสิริจึงเสด็จมาจากมหาจีนพร้อมกับพระเจ้าธรรมการ พระมเหสีทั้งสอง ชาวนา และพระภิกษุ เพื่อมาสักการะ เมื่อทรงเห็นว่าหุบเขานี้เหมาะแก่การตั้งถิ่นฐาน และเพื่ออำนวยความสะดวกแก่ผู้แสวงบุญ จึงทรงขุดช่องเขาที่โชวาร์ น้ำในทะเลสาบจึงไหลลงมาและเกิดเป็นที่ตั้งถิ่นฐาน ดอกบัวได้กลายเป็นเนินเขา และดอกบัวได้กลายเป็นเจดีย์
ในปี ค.ศ. 1349 พระเจ้าสมาสุดธิน อิลยาส แห่งรัฐสุลต่านเบงกอลได้รุกรานหุบเขากาฐมาณฑุและสร้างความเสียหายให้กับเจดีย์สเวยัมภูโดยกองทัพมุสลิม ต่อมาได้รับการซ่อมแซมโดยพระเจ้าศักติมัลเล ภัลโลกา ในปี ค.ศ. 1505 โยคีซังเย กยัลเสนได้เพิ่มวงล้อและยอดแหลมเข้าไปในโดมของเจดีย์ ในปี ค.ศ. 1614 พระชามาร์ปาองค์ ที่ 6 ได้สร้างศาลบูชาไว้ภายในเจดีย์ในทิศทั้งสี่ พระลามะสำคัญหลายองค์ของนิกายกาคยูได้ประกอบพิธีอภิเษกในปี ค.ศ. 1750 หลังจากการบูรณะครั้งใหญ่ พระอาจารย์โลปอน เชชู ริมโปเช (ค.ศ. 1918-2003) ผู้มีชื่อเสียงชาวภูฏาน อดีตเจ้าอาวาสของวัด ดรุกปา กาคยูซึ่งตั้งอยู่ทางด้านตะวันตกของเจดีย์ ได้เดินทางมายังเนปาลเพื่อช่วยเหลือลุงของท่าน คือ พระลามะเชราบ ดอร์เจ ในการบูรณะและบำรุงรักษาเจดีย์ในช่วงต้นศตวรรษที่ 20การบูรณะเจดีย์สไวัมภูครั้งล่าสุดเสร็จสมบูรณ์ในเดือนพฤษภาคม พ.ศ. 2010
หุบเขานี้ต่อมาเป็นที่รู้จักในชื่อ Swayambhu ซึ่งแปลว่าสร้างขึ้นเอง ชื่อนี้มาจากเปลวไฟนิรันดร์ (Syambhu) ซึ่งดำรงอยู่เองได้ ซึ่งต่อมาได้มีการสร้างสถูปขึ้นเหนือเปลวไฟนั้น อย่างไรก็ตาม เชื่อกันว่าจักรพรรดิอโศกได้เสด็จเยือนสถานที่แห่งนี้ในศตวรรษที่ 3 ก่อนคริสตกาล และได้สร้างวัดขึ้นบนเนินเขา ซึ่งต่อมาได้ถูกทำลายลง แต่ในประวัติศาสตร์ก็ไม่มีการพิสูจน์
แม้ว่าสถานที่แห่งนี้จะถือว่าเป็นสถานที่ศักดิ์สิทธิ์ทางพุทธศาสนา แต่ก็เป็นที่เคารพนับถือของทั้งชาวพุทธและชาวฮินดู กษัตริย์ฮินดูหลายพระองค์เคยเสด็จมาสักการะวัดแห่งนี้ รวมถึงพระเจ้าประตาป มัลลา กษัตริย์ผู้ทรงอำนาจแห่งกาฐมาณฑุ ผู้ทรงสั่งสร้างบันไดทางทิศตะวันออกในศตวรรษที่ 17 พระเจ้าประตาป มัลลาทรงสร้างวัดประตาปปุระและวัดอนันตปุระขึ้นในบริเวณเดียวกัน เจดีย์ได้รับการบูรณะครั้งใหญ่ในเดือนพฤษภาคม ปี 2010 ซึ่งเป็นการบูรณะครั้งใหญ่ครั้งแรกนับตั้งแต่ปี 1921 และเป็นการบูรณะครั้งที่ 15 ในรอบเกือบ 1,500 ปีนับตั้งแต่สร้างขึ้น โดมได้รับการปิดทองใหม่โดยใช้ทองคำหนัก 20 กิโลกรัม การบูรณะได้รับทุนสนับสนุนจากศูนย์ปฏิบัติธรรมนิกายญิงมาแห่งทิเบตในแคลิฟอร์เนีย และเริ่มขึ้นในเดือนมิถุนายน ปี 2008
เวลาประมาณ 5 น. ของวันที่ 14 กุมภาพันธ์ 2011 วัดปราตาปูร์ในเขตอนุสาวรีย์สวะยัมภูได้รับความเสียหายจากฟ้าผ่าระหว่างเกิดพายุฝนฟ้าคะนองกะทันหัน ส่วนกลุ่มอาคารสวะยัมภูนาถได้รับความเสียหายจากแผ่นดินไหวครั้งใหญ่เมื่อเดือนเมษายน 2015
